PiVAT? 生物信息學分析平臺
PiVAT? 生物信息學分析平臺
PiVAT?(The Pillar Variant Analysis Toolkit)是智能化生物信息分析軟件系統,全Web界面,一步完成從測序原始數據(bcl或fastq)到突變列表的全部分析工作。 與基于SLIMamp的NGS檢測互相補充,可得到精準可靠的突變分析結果。PiVAT軟件包可以部署在云端或本地,而且使用標準的FASTQ文件格式處理數據。
通過局部比對或者從頭合成序列拼接可以檢測到較長的indels,同時抑制了因富集和分析方法產生的錯誤。
PiVAT提供一個標準的BAM(Binary Alignment Map)文件,同時也提供了一個PBAM的PiVAT版本。兩者在標準生物信息流程中可以互換使用。

PiVAT 生信分析流程基因組比對

PiVAT 通過減少測序錯誤為損壞的樣品
提供了可靠的分析結果

評估突變檢測的精確性(樣本數:10)

普通重現誤差率(Q值≥20)用橙色表示
經PiVAT分析后較低的誤差率用綠色表示
PiVAT生分信析軟件攜手ampPD引物設計平臺和SLIMamp專利建庫技術
提供目標區域靶向檢測NGS全流程解決方案