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    PiVAT? 生物信息學(xué)分析平臺

    PiVAT? 生物信息學(xué)分析平臺

    PiVAT?(The Pillar Variant Analysis Toolkit)是智能化生物信息分析軟件系統,全Web界面,一步完成從測序原始數據(bcl或fastq)到突變列表的全部分析工作。 與基于SLIMamp的NGS檢測互相補充,可得到精準可靠的突變分析結果。PiVAT軟件包可以部署在云端或本地,而且使用標準的FASTQ文件格式處理數據。  
    通過(guò)局部比對或者從頭合成序列拼接可以檢測到較長(cháng)的indels,同時(shí)抑制了因富集和分析方法產(chǎn)生的錯誤。  
    PiVAT提供一個(gè)標準的BAM(Binary Alignment Map)文件,同時(shí)也提供了一個(gè)PBAM的PiVAT版本。兩者在標準生物信息流程中可以互換使用。

     


    PiVAT

    智能化生物信息分析系統
    全web界面操作,一步完成從測序原始數據(fastq文件)到突變列表的全部分析工作。

    PiVAT 生信分析流程基因組比對

    PiVAT bioinformatics workflow aligns FASTQ file to the human genome, performs alignments, filtering and de novo assembly for accurate variant calling

    PiVAT 通過(guò)減少測序錯誤為損壞的樣品  
     提供了可靠的分析結果

    使用肺癌結直腸癌基因檢測Panel檢測不同降解程度的FFPE標準品(Horizon Discovery)
    評估突變檢測的精確性(樣本數:10)
    x軸:Onco/Reveal泛癌種靶序列25kb y軸:誤差率
    普通重現誤差率(Q值≥20)用橙色表示
    經(jīng)PiVAT分析后較低的誤差率用綠色表示

    PiVAT生分信析軟件攜手ampPD引物設計平臺和SLIMamp專(zhuān)利建庫技術(shù)  
    提供目標區域靶向檢測NGS全流程解決方案

    ampPD?

    icon of ampPD primer as located on DNA

    獨特的引物設計滿(mǎn)足各類(lèi)檢測需求

    SLIM  amp?

    test tube icon

    二步法多重PCR實(shí)現單管高效文庫構建

    PiVAT?

    PiVat icon

    可視化分析軟件提供靈敏、全面的突變檢測

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